I. Administracja KL Lublin 1941-1944
II. „Akcja Reinhardt” – akta dowódcy SS i policji w dystrykcie lubelskim
III. Prywatne dokumenty b. członków załogi i żołnierzy niemieckich (1939-1944)
IV. Archiwum Organizacji Więźniów (1942-1944)
V. Prywatne dokumenty należące do więźniów (1813-1946)
VI. Obce registratury (1941-1944)
VII. Pamiętniki, relacje, ankiety byłych więźniów
VIII. Nagrania audio
IX. Plany obozu koncentracyjnego na Majdanku oraz plany Muzeum
X. Towarzystwo Opieki nad Majdankiem (od 1945 r.)
XI. Polski Czerwony Krzyż – Okręg Lubelski (1939-1946)
XII. Centralna Opieka Podziemia – OPUS (1943-1944)
XIII. Wojskowa Służba Kobiet (1942-1944)
XIV. Opracowania
XV. Zbiór obwieszczeń i druków ulotnych
XVI. Zbiór materiałów dotyczących hitlerowskiego więzienia na Zamku Lubelskim (1939-1944)
XVII. Zbiór fotografii
XVIII. Zbiór mikrofilmów
XIX. Zbiór fotokopii i kserokopii
XX. Akta procesowe
XXI. Zbiór akt Stowarzyszenia b. Więźniów Zamku Lubelskiego i Więzienia Pod Zegarem
XXII. Zbiór nagrań wideo
XXIII. Obóz NKWD
XXIV. Spuścizny
XXV. Polsko-Sowiecka Komisja Nadzwyczajna ds. Zbadania Zbrodni na Terenie b. Obozu Koncentracyjnego na Majdanku (1944)
XXIV. Zbiór materiałów i dokumentów dotyczących obozu zagłady w Bełżcu